Una gran parte del turismo nautico sloveno, praticato nel mare sloveno, viene rappresentata dalle barche a motore e dagli yacht. A Capodistria, Portorose e Isola, presentando la patente nautica, potete noleggiare una barca a motore. Nelle località costiere elencate si trovano i marina modernamente attrezzati che garantiscono l'approvvigionamento con il carburante. I distributori si trovano inoltre presso i moli pubblici di Pirano e Isola. A Isola si trova anche lo Yacht Center (Jahtni center) che offre servizi di riparazione. A Portorose e a Isola, ogni anno si organizzano importanti fiere nautiche: Internautica e Izola Boat Show.