Ljutomer, das Herz Prlekijas, wurde als Siedlung schon im Jahre 1242 erwähnt. Die Marktrechte erhielt es im Jahre 1265. Der Ort und seine Umgebung wurden von der Pest, heftigen Bränden und durch Überfälle von Türken und Krucen attackiert. Die Idee eines vereinigten Slowenien wurde im Jahre 1868 auf der ersten slowenischen Volksversammlung in Ljutomer ausgesprochen. Im Jahre 1927 bekam Ljutomer seine Stadtrechte. Heute knüpfen die Bibliothek, das Museum, die Kunstgalerie, der Pferdeverein und andere wichtige Vereine an die Tradition der slowenischen Nationalrenaissance des 19. Jahrhunderts an.
 
Die Weinberge rund um Ljutomer sind bekannt für ihre ausgezeichneten Weine und ihre   besonderen kulinarischen Leckerbissen (Sterze, Milchsuppe, Sahnesuppe mit Pilzen oder Kartoffeln, Pilzsuppe mit Heidensterzen, Kübelfleisch und viele andere Köstlichkeiten).