Einen großen Anteil des Nautiktourismus in slowenischen Meer stellen Motorboote und Jachten dar. In Koper, Portorož und Izola kann man Motorboote mieten. Dabei muss ein gültiger Bootsführerschein vorgelegt werden. In den erwähnten Küstenstädten befinden sich moderne Jachthäfen, die die Kraftstoffversorgung gewährleisten. Bootstankstellen gibt es außerdem an öffentlichen Pieren in Piran und Izola. In Izola befindet sich auch ein Jachtzentrum, in dem technische Reparaturen erledigt werden können. In Portorož und Izola finden alljährlich die bedeutenden internationalen Bootsmessen Internautica und die Izola Boat Show statt.