Velik del navtičnega turizma v slovenskem morju predstavljajo motorni čolni in jahte. V Kopru, Portorožu in Izoli lahko najamete motorni čoln, ob tem morate predložiti dovoljenje za voditelja čolnov. V omenjenih obalnih mestih so moderno urejene marine, ki zagotavljajo oskrbo z gorivom, črpalke pa so poleg tega tudi na javnih pomolih v Piranu in Izoli. V Izoli je tudi Jahtni center, ki omogoča tehnična pravila. V Portorožu in Izoli vsako leto priredijo pomembna mednarodna navtična sejma Internautica in Izola Boat Show.